Core facility bio-proteomica
Che cos'è
Ha lo scopo di garantire analisi di espressione differenziale e identificazione di proteine a scopo di ricerca, in futuro di diagnostica, ai ricercatori dell’Istituto. Al suo interno sono presenti attrezzature per un’analisi completa (su gel mono e/o bidimensionale) di proteine marcate in fluorescenza ed elaborazione della loro abbondanza mediante software dedicati (2D-DIGE). L’identificazione delle proteine di interesse avviene mediante spettrometria di massa (MS) dopo frazionamento su gel o direttamente mediante cromatografia liquida/MS, con l’ausilio di software dedicati (Mascot). Proteine di particolare interesse vengono validate mediante immuno-blot, ELISA e tecnologia Luminex. Pathway di interazione fra le proteine vengono analizzati utilizzando i software String e David.
Strumentazione
- Piattaforma completa per analisi mono e bidimensionale di proteine su gel.
- Spot-liquid handle.
- Acquisitore di immagine compatibile con 2D-DIGE software.
- Sostituzione dello Spettrometro di massa (in fase di acquisizione).
- Luminex Xponent.
Peculiarità
- Analisi quantitativa di un elevato numero di proteine in contemporanea da diversi preparati biologici, quali tessuto, liquidi biologici o batteri.
- Grande sensibilità e riproducibilità supportata dalla presenza di standard interni ai campioni.
- Affidabilità statistica delle letture.
- Possibilità di eseguire ulteriori analisi a posteriori sui dati in memoria.
- Possibilità di mettere in relazione fra loro più caratteristiche di uno stesso processo biologico.
- Determinazione qualitativa.
- Supporto di un team esperto per la preparazione dei campioni e interpretazione dei risultati.
Applicazioni di ricerca al CRO
- Analisi di pattern di espressione di proteine intracitoplasmatiche e nucleari.
- Valutazione dell’espressione di specifici marcatori presenti in situazioni preneoplastiche, autoimmuni, associate a specifici patogeni o neoplastiche prima o dopo il trattamento con agenti farmacologici.
- Analisi quantitativa di specifiche molecole e/o della produzione di proteine, chemochine e citochine.
- Analisi di interazioni fra proteine come segnalazione intra- ed extra-cellulare.